docs: 文档清理与重构 — 统一为 3 个核心文档

- 删除 5 个过时/残留文档(project_plan/agent_prompt/optimization_plan/report_db_design/deploy/README)
- 新建 docs/architecture.md(项目架构:11 包职责+数据模型+配置+产物)
- 重写 docs/user-guide.md(CLI 全量+增量/断点续跑+MCP+FAQ)
- 重写 README.md(精简入口+文档索引)
- 更新 continuation.md(追加本次记录)
- 更新 .gitignore(排除 data/* 运行产物)

.gitignore

@@ -0,0 +1,78 @@
+# Python
+__pycache__/
+*.py[cod]
+*$py.class
+*.so
+.Python
+.venv/
+venv/
+env/
+build/
+dist/
+*.egg-info/
+*.egg
+.eggs/
+
+# uv
+# uv.lock 应保留以锁定生产环境依赖版本(本项目为应用而非库)
+
+# 测试 / 覆盖率
+.pytest_cache/
+.coverage
+htmlcov/
+.tox/
+.mypy_cache/
+.ruff_cache/
+
+# IDE
+.vscode/
+.idea/
+*.swp
+*.swo
+
+# OS
+.DS_Store
+Thumbs.db
+
+# 工具本地配置（非项目文件）
+reasonix.toml
+
+# 项目敏感配置
+.env
+.env.local
+.env.*.local
+*.key
+*.pem
+
+# 运行产物
+logs/*.log
+logs/*.log.*
+data/raw/
+data/processed/
+data/cache/
+data/pipeline/
+data/dedup/
+data/deduped/
+data/events/
+data/embeddings/
+data/qdrant_storage/
+data/reports_history/
+data/reports/
+data/
+data/reports/
+*.sqlite
+*.sqlite3
+*.db
+
+# 日志目录(非 logs/ 下的)
+configs/logs/
+
+# Docker 卷
+qdrant_storage/
+
+# 调试输出
+debug/
+tmp/
+
+# M10: 历史日报源文件副本(可从 doorcome 重新拉取)
+data/reports_history/